В соответствии с Федеральным законом от 29.12.2006г. №256-ФЗ «О дополнительных мерах государственной поддержки семей, имеющих детей» (в ред. Федерального закона от 28.07.2010г. №241-ФЗ) средства материнского (семейного) капитала в соответствии с заявлением о распоряжении средствами могут направляться на приобретение (строительство) жилого помещения, осуществляемое гражданами посредством совершения любых не противоречащих закону сделок и участия в обязательствах (включая участие в жилищных, жилищно-строительных и жилищных накопительных кооперативах), путем безналичного перечисления указанных средств организации, осуществляющей отчуждение (строительство) приобретаемого (строящегося) жилого помещения, либо физическому лицу, осуществляющему отчуждение приобретаемого жилого помещения, либо организации, в том числе кредитной, предоставившей по кредитному договору (договору займа) денежные средства на указанные цели.
Направление средств материнского (семейного) капитала на ремонт жилого помещения законодательством о дополнительных мерах государственной поддержки семей, имеющих детей, не предусмотрено.
При этом жилое помещение, приобретаемое (строящееся) за счет средств материнского капитала, должно находиться в собственности членов семьи владелицы государственного сертификата на М(С)К.
С учетом изложенного, отремонтировать крышу дома, равно как и достроить 2 этаж, либо ванную комнату Вы не сможете.
В Вашем случае на принадлежащем Вам на праве собственности земельном участке Вы сможете построить отдельное жилое помещение (не строение). Одним из необходимых условий в данном случае будет являться факт достижения ребенком, в связи с рождением которого возникло право на дополнительные меры государственной поддержки, трехлетнего возраста.

"1. Средства (часть средств) материнского (семейного) капитала в соответствии с заявлением о распоряжении могут направляться:
...
2) на строительство, реконструкцию объекта индивидуального жилищного строительства, осуществляемые гражданами без привлечения организации, осуществляющей строительство (реконструкцию) объекта индивидуального жилищного строительства, в том числе по договору строительного подряда, путем перечисления указанных средств на банковский счет лица, получившего сертификат.";
...
в) дополнить частью 1.2 следующего содержания:
"1.2. Часть средств материнского (семейного) капитала, оставшаяся в результате распоряжения ими в соответствии с частью 1.1 настоящей статьи, может быть использована на те же цели не ранее чем по истечении шести месяцев со дня предыдущего направления части средств материнского (семейного) капитала при представлении лицом, получившим сертификат, документа органа, уполномоченного на выдачу разрешения на строительство, подтверждающего проведение основных работ по строительству объекта индивидуального жилищного строительства (монтаж фундамента, возведение стен и кровли) или проведение работ по реконструкции объекта индивидуального жилищного строительства, в результате которых общая площадь жилого помещения (жилых помещений) реконструируемого объекта увеличивается не менее чем на учетную норму площади жилого помещения, устанавливаемую в соответствии с жилищным законодательством Российской Федерации. Выдача указанного документа осуществляется по форме, утвержденной уполномоченным Правительством Российской Федерации федеральным органом исполнительной власти, в порядке, определяемом Правительством Российской Федерации.";